内蒙吸附式干燥机对于冰冻样品的升化效率取决于几个因素。其中最重要的冷冻产品与收集器之间的气压差。最有效的冷冻干燥发生在样品在它所能承受的最高温度，同时仍能保持冰冻壮态，与此同时收集器温度和系统真空度保持在所能达到的最低值。

干燥时间的变化依赖于被冷冻干燥的材料的低共熔温度。内蒙吸附式干燥机对于绝大多数的生物材料，这个温度低于0℃，有的甚至要低于-40℃。